Etter paringen kan det ta noe tid, men ca 45 dager etter eggløsning vil hunnen legge mellom 10 og 30 egg. Disse vil hun så ruge ut i løpet av de neste 49 dagene. Man vet lite om hvordan dette foregår i naturen, da ingen enda har kommet over en rugende grønn trepyton i det fri. I fangenskap gir man dem en passelig stor boks de kan krype inn i, så man antar de de finne seg et skjulested i naturen hvor forholdene er ideelle og de får ruge i fred. Hule trestammer blir ofte nevnt. Etter 49 dager skjærer de en åpning i egget med en medfødt “eggtann” som de senere mister. De blir sittende i egget noen dager til eggeplommen er oppbrukt og navlestrengen løsnet. Når de forlater egget er de umiddelbart på egenhånd og får ingen videre oppfølging eller omsorg av mor. I fangenskap går som regel de ti første dagene med til å fordøye siste rest av eggeplommen før de gjennomfører første hamskifte og begynner å jakte på mat.